本病由溶組織阿米巴原蟲寄生於人結腸內引起。隨著營養和衛生條件的改善，感染率已明顯下降。

糞便檢查是確診的重要依據。發現病原體後尚需鑒別非致病性阿米巴原蟲。目前血清學檢查發展很快，是診斷阿米巴病的關鍵性實驗，大約有90%的患者血清，可通過ELISA、間接血凝及間接免疫熒光等檢測不同滴度的抗體。PCR診斷技術為十分有效、敏感及特異的方法。WHO專門委員會建議，鏡下檢獲含四核的包囊，應鑒定為溶組織內阿米巴或迪斯帕內阿米巴;糞中檢測含紅細胞的滋養體，應高度懷疑為溶組織內阿米巴;血清學檢查高滴度陽性，應高度懷疑為溶組織內阿米巴感染。阿米巴病僅由溶組織內阿米巴引起。1.結腸鏡檢查 對那些顯微鏡檢查、血清學及PCR檢查均未獲陽性結果，而臨床高度懷疑的病例，可行結腸鏡檢查或纖維腸鏡檢查。約2/3有症状病例中，直腸和乙狀結腸黏膜可見大小不等的散在潰瘍，表面覆有黃色膿液，邊緣略突出，稍充血，潰瘍與潰瘍之間的黏膜正常。從潰瘍面刮取材料作鏡檢，發現滋養體機會較多。2.X線鋇劑灌腸檢查　病變部有充盈缺損、痙攣及壅塞現象。此種發現雖無特異性，但有助於阿米巴瘤與腸癌的鑒別。阿米巴結腸炎應與急、慢性腸炎，急、慢性菌痢，非特異性潰瘍性結腸炎，結腸癌等相鑒別。最主要的是糞便檢查和乙狀結腸鏡檢查。還應與其他寄